Förderung durch den Bund
Finanzierungsprogramme des Bundes zeichnen sich in der Regel durch folgende Merkmale aus:
- In der Regel Verbund-/Kooperationsprojekte von mehreren Partnern, sog. FuE-Projekte (Forschung- und Entwicklungsvorhaben) mit Unternehmenspartnern,
- Antragstellung nur im Rahmen termingebundener Ausschreibungen möglich,
- Anwendungsorientierung der Vorhaben unter Kooperation mit kleinen und mittleren Unternehmen und/oder universitären Partnern,
- meist zweistufiges Antragsverfahren.
Auf Bundesebene fördern unter anderem die folgenden drei Institutionen programmorientierte Forschungsvorhaben:

Das BMBF fördert Projekte mit gezielten Förderlinien und Themenfeldern, die per Newsletter angekündigt werden:
- High-Tech-Strategie und Innovationen
(u.a. Informations- und Kommunikationstechnologien, Zukunft von Arbeit, Produktion und Konsum, Klima, Energie, Gesundheit, Mobilität) - Digitale Wirtschaft und Gesellschaft
- Umwelt und Nachhaltigkeit
(u.a. nachhaltige Entwicklungen/FONA, Biodiversität, Energie, Gesellschaft und Ökonomie) - Energiewende und nachhaltiges Wirtschaften, darunter Bioökonomie und Elektromobilität
- Gesundheitsforschung
Geistes-, Kultur- und Sozialwissenschaften (2017 beendet) - internationale Forschungskooperationen, darunter Anbahnungshilfen und wissenschaftlich-technologische Zusammenarbeit mit Partnern in bestimmten Ländern, je nach Ausschreibung verschieden

Das BMUV fördert insbesondere Projekte zur Verminderung von Umweltbelastungen im In- und Ausland.
Folgende Förderschwerpunkte sind derzeit festgelegt, die per Newsletter angekündigt werden:
- Klima und Energie (u.a. Klimaschutz und -anpassung, Emissionshandel, Energieeffizienz)
- Umwelt- und Naturschutz (u.a. Ressourceneffizienz und -schonung, biologische Vielfalt, Artenschutz)
- Wasser, Ressourcen und Abfall
- Luft, Lärm und Mobilität (u.a. Verkehr, Elektromobilität)
- Gesundheit (u.a. Chemikalien, Nano-Technologie)
- Nachhaltigkeit, Digitalisierung
- Verbraucherschutz
- Europa, Internationales
- Bildung, Beteiligung

Das BMWK fördert anwendungsorientierte Verbundprojekte von Hochschulen und Unternehmen.
Folgende Förderschwerpunkte sind derzeit festgelegt, die per Newsletter ausgeschrieben werden:
- Technologieoffene Projektförderung
mit Kooperationen zwischen Hochschulen und Unternehmen, u.a. über das Zentrale Innovationsprogramm Mittelstand (ZIM) - Schlüsseltechnologien
darunter Biotechnologie, Elektromobilität, Informations- und Kommunikationstechnologien, Mikrosystem-, Produktions- und optische Technologien, Luftfahrt, Verkehrs- und Logistiksysteme - Energieforschung
- Vorwettbewerbliche Forschung für den Mittelstand
Die Beauftragte der Bundesregierung für Kultur und Medien (BKM) fördert insbesondere Erforschung, Erhaltung und Präsentation deutscher Kultur und Geschichte im östlichen Europa. Gleiches gilt für das Bundesinstitut für Kultur und Geschichte der Deutschen in östlichen Europa (BKGE).
Die Förderung durch den Deutschen Akademischen Austauschdienst (DAAD) wird nicht von der Abteilung für Forschungsförderung betreut.